Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFA9Q16795 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms