Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FSCN1Q16658 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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