Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CTF1Q16619 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CTF1Q16619 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTF1Q16619 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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