Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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