Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIN2CQ14957 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms