Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIXQ14938 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms