Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RASGRF1Q13972 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms