Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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NCOA4Q13772 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCOA4Q13772 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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