Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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