Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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