Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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