Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms