Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CREMQ03060 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms