Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MDM2Q00987 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2157.1 ms