Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLR2FP61218 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms