Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms