Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms