Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
DAP3P51398 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
DAP3P51398 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms