Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT8P50990 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCT8P50990 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms