Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms