Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AFMP43652 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AFMP43652 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms