Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC1A1P43005 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms