Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNB1P35222 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms