Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL9P32969 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL9P32969 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms