Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA7P31268 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms