Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD1P28340 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms