Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HLA-DMAP28067 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms