Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms