Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BCKDHBP21953 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BCKDHBP21953 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BCKDHBP21953 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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