Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNNI3P19429 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNNI3P19429 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNNI3P19429 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNNI3P19429 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNNI3P19429 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNNI3P19429 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TNNI3P19429 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TNNI3P19429 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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