Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms