Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms