Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 570.1 ms