Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2AF1L5P0DN76 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U2AF1L5P0DN76 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
U2AF1L5P0DN76 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
U2AF1L5P0DN76 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
U2AF1L5P0DN76 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
U2AF1L5P0DN76 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
U2AF1L5P0DN76 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
U2AF1L5P0DN76 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
U2AF1L5P0DN76 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms