Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYBBP04839 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYBBP04839 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYBBP04839 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYBBP04839 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYBBP04839 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms