Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TGFB1P01137 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFB1P01137 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms