Protein–RNA interactions for Protein: O14709

ZNF197, Zinc finger protein 197, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF197O14709 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF197O14709 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms