Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms