Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNAP23O00161 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms