Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms