Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NPIPB13A6NJU9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms