Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms