Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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HECTD4Q9Y4D8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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HECTD4Q9Y4D8 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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HECTD4Q9Y4D8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
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