Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC8Q9Y2L5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms