Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP164Q9UPV0 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP164Q9UPV0 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP164Q9UPV0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP164Q9UPV0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms