Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCML1Q9UN30 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms