Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5BQ9UGL1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM5BQ9UGL1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms