Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms