Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TFIP11Q9UBB9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms