Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms